(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202211190162.7 (22)申请日 2022.09.28 (71)申请人 中国农业科 学院郑州果 树研究所 地址 450009 河南省郑州市管城回族区南 曹乡安徐庄 (72)发明人 刘文革　朱红菊　何楠　路绪强　 龚成胜　 (74)专利代理 机构 北京轻创知识产权代理有限 公司 11212 专利代理师 陈熙 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种用于鉴定西瓜 皮厚度的SNP分子标记及 其应用 (57)摘要 本发明涉及一种用于鉴定西瓜 皮厚度的SNP 分子标记及其应用， 涉及生物技术领域， 所述SNP 分子标记位于西瓜基因组第2号染色体的第 32344170位碱基， 所述碱基为C或T， 若基因型为 CC， 则对应西瓜皮厚度小于等于0.6cm， 若基因型 为GG， 则对应西瓜皮厚度大于0.6cm。 有效加速育 种进程， 提高育种效率， 对西瓜育种具有重要的 意义。 权利要求书1页 说明书9页 附图1页 CN 115505649 A 2022.12.23 CN 115505649 A 1.一种用于鉴定西瓜皮厚度的SNP分子标记， 其特征在于， 所述SNP分子标记位于西瓜 基因组第2号染色体第3234 4170位碱基， 所述碱基为C或T。 2.根据权利要求1所述的一种用于鉴定西瓜皮厚度的SNP分子标记， 其特征在于， 若基 因型为CC， 则对应西瓜皮厚度小于等于0.6cm， 若基因型为GG， 则对应西瓜皮厚度大于 0.6cm。 3.根据权利要求1所述的一种用于鉴定西瓜皮厚度的SNP分子标记， 其特征在于， 所述 西瓜为西瓜9710 3。 4.一种鉴定西瓜皮厚度的SNP分子标记的应用， 其特征在于， 权利 要求1所述SNP 分子标 记在西瓜皮厚度鉴定中的应用； 或权利要求1所述SNP分子标记在西瓜育种中的应用。 5.一种西瓜的育种方法， 其特 征在于， 包括如下步骤： 将检测得到基因 组中SNP分子标记为C C的样品西瓜， 作为亲本进行西瓜育种。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 115505649 A 2一种用于鉴定西瓜皮厚度的SNP分子标记及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及生物技术领域， 具体涉及一种用于鉴定西瓜皮厚度的SNP分子标记及 其应用。 背景技术 [0002]西瓜作为一种重要的葫芦科作物， 是人们夏季消暑解渴 的重要水果， 在世界园艺 作物中占有非常重要的地位。 中国是世界上西瓜生产和消费第一大国。 果皮厚度是西瓜的 重要农艺性状之一， 直接影响西瓜的可食率和商品率， 是西瓜重要的育种指标。 目前关于西 瓜果皮性状的研究主要集中在果皮颜色、 覆纹、 蜡粉、 硬度等的基因定位和标记开发上， 但 是关于西瓜果皮厚度的研究尚未 见报道。 [0003]近年来， 多基因标记筛选方法发展迅速， 全基因组关联分(Genome ‑Wide  Association  Study,GWAS)已成为主流方法之一， 其可在全基因组范围内筛选某个性状的 相关变异， 通过全基因组关联分析方法鉴定低遗传力性状的遗传标记已成为现代育种工作 的常用手段。 SNP分子标记(single  nucleotide  polymorphisms， 单核苷酸多态性)是指在 基因组水平上由于单个核苷酸的突变所引起的DNA序列的改变。 广泛的存在于基因组上， 具 有高通量、 简单、 稳定、 灵敏度高等特定， 是目前分子标记辅助育种工作中极具发展前景 的 分子标记。 [0004]随着西瓜基因组时代的到来， 明确西瓜重要农艺性状基因功能， 并寻找控制这些 性状的关键基因， 并开发相 应的分子标记， 将分子标记应用于育种 是目前西瓜育种工作的 一项重要内容。 因此， 本发明提供一种用于鉴定西瓜皮厚度的SNP分子标记及其应用。 发明内容 [0005]本发明所要解决的技术问题是提供一种用于鉴定西瓜皮厚度的SNP分子标记及其 应用。 目的是开发与西瓜果皮厚度相关的分子标记并将其应用于西瓜育种工作， 加快西瓜 育种进程。 [0006]本发明为了解决上述技术问题， 第一个目的是提供一种用于鉴定西瓜皮厚度的 SNP分子标记， 所述SNP分子标记 位于西瓜基因组第2号染色体的第32344170位碱基， 所述碱 基为C或T。 [0007]本发明的有益效果是： 本 发明利用全基因组关联分析(GWAS)鉴定得到了与西瓜果 皮相关的5个显著 性SNP位点， 之后结合转录组测序对显著性SNP位点上下游100kb附近的候 选基因进 行分析， 确定了与西瓜果皮厚度相关的候选基因， 基于候选基因， 最 终确定西 瓜基 因组第2号 染色体的第32344170位SNP位点与西瓜果皮厚度紧密连锁。 因此本发 明与西瓜果 皮厚度相关的SNP标记可促进西瓜果皮厚度的分子标记辅助选择， 有效加速育种进程， 提高 育种效率， 对西瓜育种具有重要的意 义。 [0008]在上述技术方案的基础上， 本发明还可以做如下改进。 [0009]进一步， 若基因型为CC， 则对应西瓜皮厚度 小于等于0.6cm， 若基因型为GG， 则对应说　明　书 1/9 页 3 CN 115505649 A 3