(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210665302.5 (22)申请日 2022.06.13 (71)申请人 天津市农业科 学院 地址 300192 天津市南 开区白堤路268号 (72)发明人 李千军　崔茂盛　张丰霞　马墉　 李宁　郑梓　穆淑琴　孙红梅　 (74)专利代理 机构 济南日新专利代理事务所 (普通合伙) 37224 专利代理师 杨亚男 (51)Int.Cl. C12Q 1/6883(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种用于预测母猪二胎综合征的SNP分子标 记及其应用 (57)摘要 本发明涉及一种用于预测母猪 “二胎综合 征”的SNP分子标记及其应用， 属于分子标记 检测 技术领域。 本发明首次发现猪第12号染色体上第 43594186bp位点的SNP分子标记与母猪 “二胎综 合征”发生相关， 基因型为AA时， 母猪 “二胎综合 征”发生率较高； 基因型为AC或CC时， 母猪 “二胎 综合征”发生率较低。 利用本发明所述SNP分子标 记， 不仅可以在种猪早期快速 预测“二胎综合征 ” 的发生情况， 同时还可用于低 “二胎综合征 ”发生 率种猪的选育。 本发明对于 无“二胎综合征 ”母猪 选育具有重要的意 义。 权利要求书1页 说明书4页 附图2页 CN 115044666 A 2022.09.13 CN 115044666 A 1.一种用于预测母猪 “二胎综合征 ”的SNP分子标记， 其特征在于， 所述SNP分子标记位 于猪参考基因组10.2版本的第12号染色体上第43 594186bp位 点， 该位点存在A/ C碱基突变。 2.权利要求1所述SNP 分子标记在预测母猪 “二胎综合征 ”和/或选育低 “二胎综合征 ”发 生率的种猪中的应用。 3.根据权利 要求2所述的应用， 其特征在于， 在第12号染色体第43594186bp位点基因型 为AA时， 母猪 “二胎综合征 ”发生率较高； 基因型为AC或CC时， 母猪 “二胎综合征 ”发生率较 低。 4.根据权利要求2所述的应用， 其特征在于， 在选育低 “二胎综合征 ”发生率的种猪时， 不断选择保留种母猪群体中第12号染色体第43594186bp位置的SNP分子标记为C的基因后 代， 不断淘汰种母猪 群中第12号染色体第43 594186bp位置的SNP分子标记为A的基因后代。 5.一种用于检测如权利要求1所述SNP分子标记 的引物组合， 其特征在于， 其上游引物 序列为： AC CCAAACAGAGGCAACACAG； 下游引物序列为： T TTAGCACCACCAGAGTTTGAGG。 6.一种用于预测母猪 “二胎综合征 ”的试剂盒， 其特征在于， 包括权利要求5所述的引物 组合。 7.根据权利要求6所述用于预测母 “猪二胎综合征 ”的试剂盒， 其特征在于， 所述试剂 盒 还包括dNTPs、 Taq  DNA聚合酶、 Mg2+、 PCR反应缓冲液。 8.权利要求5所述引物组合或权利要求6～7任意项所述试剂盒在预测母猪 “二胎综合 征”和/或选育低“二胎综合征 ”发生率的种猪中的应用。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 115044666 A 2一种用于预测母猪二胎综合征的SNP分子标记及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及一种用于预测母猪 “二胎综合征 ”的SNP分子标记及其应用， 属于分子 标记检测技 术领域。 背景技术 [0002]初产母猪较易出现难产、 产程长、 产后易感染、 乳房发育不良， 二胎窝产仔数少、 断 奶后反复发情、 奶水不足等等现象， 称为 “二胎综合征 ”。 管理水平较高的规模化猪场母猪 “二胎综合征 ”发生率较低， 约为 10％左右， 而饲养管 理水平相对较差的小养殖场户， 二胎综 合征发生率可达30％， 甚至更高。 二胎综合征的出现严重影响母猪繁殖成绩， 并造成二胎母 猪较高的淘汰率， 给猪场带来较大的经济损失。 [0003]有关母猪二胎综合征产生的原因， 国内外研究者已做了大量探讨， 普遍认为二胎 综合征的发生率与饲养管理如配种日龄、 营养水平和哺乳时间等等因素有关。 但即使在管 理水平较高的大型规模养殖场， 仍有10％左右的母猪会发生 “二胎综合征 ”。 有报道指出， 一 些母猪生长发育缓慢， 特别是骨架、 骨盆和产道发育状态对二胎综合征影响较大。 因此本研 究团队推测， 尽管母猪 “二胎综合征 ”的发生率与上述饲养管理水平的高低有关， 但 “二胎综 合征”也可能与某些基因的表达有关， 并首次提出科学 的饲养管理虽然能够降低母猪二胎 综合征的发生率， 但并不能彻底解决母猪二胎综合征问题， 如果将分子标记， 特别是将 基因 组选育(GS)技术应用于二胎综合征母猪的研究， 筛选出母猪二胎综合征相关的SNP  分子标 记， 必将大大提高无二胎综合征母猪选育的精确性， 再辅以科学规范的饲养管 理， 有望从根 本上解决母猪二胎综合征问题。 [0004]目前GWAS已广 泛应用于候选基因筛选相关研究， 如杜洛克母猪初情期日龄的相关 研究、 猪腹股沟/阴囊疝易 感基因的筛选、 杜洛克猪生长性状研究以及不同种猪瘦肉量全基 因组关联分析等 等。 [0005]但到目前为止， 在国内外还未见利用GWAS技术探讨猪 “二胎综合征 ”相关分子标记 的研究。 发明内容 [0006]本发明主要目的在于提供一种用于预测母猪 “二胎综合征 ”的SNP分子标记及其应 用。 本发明首次发现位于猪第12号染色体上第43594186b p位点的SNP分子标记与母猪 “二胎 综合征”发生相关， 通过检测SNP位点突变信息可以预测母猪二胎综合征发生概率， 并用于 种猪无“二胎综合征 ”分子标记辅助育种工作。 [0007]为实现上述目的， 本发明采用以下技 术方案： [0008]本发明第一方面提供一种用于预测母猪 “二胎综合征 ”的SNP分子标记， 所述S NP分 子标记位于猪参考基因组10.2版本的第12号染色体上第43594186bp位点， 该位点存在  A/C 碱基突变。 [0009]本发明第二方面提供以上第一方面所述SNP分子标记在预测母猪 “二胎综合征 ”说　明　书 1/4 页 3 CN 115044666 A 3