(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210622297.X (22)申请日 2022.06.02 (71)申请人 扬州大学 地址 225009 江苏省扬州市大 学南路88号 (72)发明人 韦存虚　赵胜男　林令尚　张龙　 王娟　 (74)专利代理 机构 南京纵横知识产权代理有限 公司 32224 专利代理师 董建林 (51)Int.Cl. C12N 15/54(2006.01) C12N 9/10(2006.01) C12N 15/11(2006.01) C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/82(2006.01)A01H 5/00(2018.01) A01H 6/46(2018.01) (54)发明名称 一种调控抗性淀粉含量的水稻SBEIIb等位 基因及其在育种中的应用 (57)摘要 本发明属于分子遗传学领域， 公开了一种调 控抗性淀粉含量的水稻 SBEIIb等位基因。 该基因 在野生型水稻品种日本晴的SBEIIb基因第16外 显子上的第56位 腺嘌呤(A)被鸟嘌呤(G)替换， 其 核苷酸序列如SEQ  ID No.1所示， 编码区序列如 SEQ ID No.2所示， 所述水稻SBEIIb等位基因编 码的蛋白氨基酸序列如SEQ  ID No.3所示。 上述 SBEIIb等位基因对直链淀粉含量无显著 影响， 但 改变水稻支链淀粉的链长； 可显著提高米饭的抗 性淀粉含量和降低米饭葡萄糖生成速率， 且对稻 米品质影 响较小， 在高抗性淀粉 水稻育种中具有 很强的应用。 权利要求书1页 说明书6页 序列表10页 附图5页 CN 114921479 A 2022.08.19 CN 114921479 A 1.一种调控抗性淀粉含量的水稻SBEIIb等位基因， 其特征在于， 在野生型水稻品种日 本晴SBEIIb基因基础上， 第16外显子上的第56位A被G替换； 所述的水稻SBEIIb等位基因其 核苷酸序列如SEQ  ID No.1所示。 2.根据权利 要求1所述的调控抗性淀粉含量的水稻SBEIIb等位基因， 其特征在于， 其编 码区序列如SEQ  ID No.2所示。 3.一种用于检测调控抗性淀粉含量的水稻SBEIIb等位基因的引物， 其特征在于， 所述 引物的上游序列如SEQ  ID NO:6所示， 所述引物的下游序列如SEQ  ID NO:7所示。 4.根据权利要求1或2所述的水稻SBEIIb等位基因所编码的蛋白， 其特征在于， 在野生 型日本晴SBEIIb蛋白基础上， 第583位氨基酸精氨酸(Arg)被甘氨酸(Gly)替换； 所述的水稻 SBEIIb等位基因所编码蛋白的氨基酸序列如SEQ  ID No.3所示。 5.根据权利要求1所述的水稻SBEI Ib等位基因在高抗 性淀粉水稻育种中的应用。 6.根据权利 要求5所述的应用， 其特征在于， 所述水稻SBEIIb等位基因提高水稻支链淀 粉长侧链的比例。 7.根据权利 要求5所述的应用， 其特征在于， 水稻SBEIIb等位基因提 高米饭的抗性淀粉 含量并降低葡萄糖生成速率。 8.根据权利要求5所述的应用， 其特征在于， 水稻SBEIIb等位基因提高稻米的糊化温 度。 9.根据权利要求5所述的应用， 其特征在于， 将权利要求1或2所述的基因目标碱基通过 基因编辑技术改变目的水稻的目标碱基， 得到目标碱基替换 的水稻材料； 所述目标碱基替 换的水稻 稻米尿素糊化 抗性高于所述目的水稻。 10.根据权利要求9所述 的应用， 其特征在于， 以序列为SEQ  ID NO:4和SEQ  ID NO:5的 引物对T0代植株进行扩增。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114921479 A 2一种调控抗性淀 粉含量的水稻SBEI Ib等位基因及其在育种中 的应用 技术领域 [0001]本发明涉及一种调控抗性淀粉含量的水稻SB EIIb等位基因及其在育种中的应用， 属于分子 遗传学领域。 背景技术 [0002]抗性淀粉(Resistant  starch,RS)是指不能被健康人体小肠酶解， 但可以在人的 结肠中被发酵分解的淀粉及其降解物。 摄食富含RS的食物可以维持餐后血糖水平和改善肠 道健康。 随着人们生活水平提高和生产方式的改变， 患超重、 肥胖和糖尿病等的人群在逐年 增加， 而摄食富含RS的食物可以有效预防和延缓上述疾病的发生。 淀粉分支酶IIb(Starch   branching  enzyme IIb,SBEIIb)负责支链淀粉侧链的形成， 调 控稻米抗性淀粉含量， 因此 挖掘水稻SBEIIb等位基因非常重要。 目前， 国内外育种学家已经挖掘了很多SBEIIb等位基 因， 它们大多导致SBEIIb缺失或活性显著降低， 最终形成粉质籽粒， 而粉质籽粒的外观、 产 量和蒸煮食味品质等较差， 限制了其在 农业生产和人们生活中的直接应用。 发明内容 [0003]本发明旨在提供一种调控抗性淀粉含量的水稻SBEIIb等位基因及其在育种中的 应用， 尤其是在高抗性淀粉 水稻育种中的应用， 它显著改变支链淀粉链长 分布， 提高稻米抗 性淀粉含量， 但不影响直链淀粉含量和稻米外观品质， 显示在高抗性淀粉稻米育种中有很 强的应用前 景。 [0004]本发明提供的技 术方案如下： [0005]一种调控抗性淀粉含量的水稻SB EIIb等位基因， 在野生型水稻品种日本晴SB EIIb 基因基础上， 第16外显子上的第56位A被G替换； 所述的水稻SBEIIb等位基因其核苷酸序列 如SEQ ID No.1所示。 [0006]进一步地， 其编码区序列如SEQ  ID No.2所示。 [0007]本发明还提供一种用于检测调控抗性淀粉含量的水稻SB EIIb等位基因的引物， 所 述引物的上游序列如SEQ  ID NO:6所示， 所述引物的下游序列如SEQ  ID NO:7所示。 [0008]本发明还提供上述水稻SB EIIb等位基因所编码的蛋白， 在野生型日本晴SBEIIb蛋 白基础上， 第583位氨基酸精氨酸(Arg)被甘氨酸(Gly)替换； 所述的水稻SBEIIb等位基因所 编码蛋白的氨基酸序列如SEQ  ID No.3所示。 [0009]本发明还提供 上述水稻SBEI Ib等位基因在高抗 性淀粉水稻育种中的应用。 [0010]进一步地， 所述水稻SBEI Ib等位基因提高水稻支 链淀粉长侧链的比例。 [0011]进一步地， 水稻SBEIIb等位基因提高米饭的抗性淀粉含量并降低葡萄糖生成速 率。 [0012]进一步地， 水稻SBEI Ib等位基因提高稻米的糊化温度。 [0013]进一步地， 将权利要求1或2所述的基因目标碱基通过基因编辑技术改变目的水稻说　明　书 1/6 页 3 CN 114921479 A 3