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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210669198.7 (22)申请日 2022.06.14 (71)申请人 中国农业科 学院郑州果 树研究所 地址 450009 河南省郑州市管城回族区未 来路南端郑州果 树研究所 (72)发明人 朱迎春 孙德玺 王一帆 袁高鹏 刘君璞 李卫华 安国林 (74)专利代理 机构 郑州大通专利商标代理有限 公司 41111 专利代理师 蔡少华 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 与西瓜叶片黄化性状相关的InDel分子标记 及其应用 (57)摘要 本发明属于分子标记 技术领域, 公开了一种 与西瓜叶片黄化性状相关的InDel分子标记, 所 述InDel分子标记的连锁 基因位点开始 于西瓜参 考基因组97103V2版本的第2号染色体第 16217471bp位碱基处, 所述InDel分子标记的扩 增长度为122bp和/或142bp, 若扩增基因片段长 度为122bp则为西瓜 叶片黄化纯合单株, 若扩增 基因片段长度为142bp则为西瓜叶片正 常绿纯合 单株, 若扩增基因片段长度为122bp和142bp则为 西瓜叶片正常绿杂合单株。 本发明开发的InDel 分子标记, 可 以用来对品种进行初期筛选, 检测 方法正确可靠, 达到分子标记辅助育种的目的, 能够大大缩短育种周期, 具有重要的理论及实践 意义。 权利要求书1页 说明书4页 序列表1页 附图1页 CN 115058536 A 2022.09.16 CN 115058536 A 1.与西瓜叶片黄化性状相 关的InDel分子标记, 其特征在于, 所述InDel分子标记的连 锁基因位点开始于西瓜参考基因组97103V2版本的第2号染色体第16217471bp位碱基处, 所 述InDel分子标记的扩增长度为122bp和/或142bp, 若扩增基因片段长度为122bp则 为西瓜 叶片黄化纯合单株, 若扩增基因片段长度为 142bp则为西瓜叶片正常绿纯合单株, 若扩增基 因片段长度为12 2bp和142bp则为西瓜叶片正常绿杂合单株。 2.扩增与西瓜叶片黄化性状相关的InDel分子标记的引物对, 其特征在于, 所述引物对 的正向引物序列如SEQ ID NO.3所示、 反向引物序列如SEQ ID NO.4所示。 3.利用权利要求2所述的引物对鉴定西瓜叶片颜色是否黄化的方法, 其特征在于, 包括 以下步骤: 提取待测西瓜样 品的基因组DNA; 利用引物对对西瓜基因组DNA进行PCR扩增; 根 据PCR扩增产 物的电泳条带判断西瓜叶片 黄化性状的等位基因型, 若只显示122bp条带则该 西瓜为黄化纯合单株, 若只显示142bp条带则该西瓜为正常绿纯合单株, 若显示122bp和 142bp两个条 带则该西瓜为 正常绿杂合单株。 4.权利要求2所述的引物对在鉴定西瓜叶片颜色是否 黄化中的应用。 5.权利要求2所述的引物对在西瓜叶片颜色是否 黄化的分子标记辅助育种中的应用。 6.含有扩增与西瓜叶片黄化 性状相关的I nDel分子标记的引物对的试剂盒。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 115058536 A 2与西瓜叶片黄化性状相关的InDel分子标记及其应用 技术领域 [0001]本发明属于分子标记技术领域, 涉及一种与西瓜叶片黄化性状相关的InDel分子 标记及其应用。 背景技术 [0002]作为一种重要的葫芦科作物, 西 瓜(Citrulluslanatus)是人们夏季消暑解渴的重 要水果, 在世界园艺作物中占有非常重要的地位。 中国作为世界上西瓜生产和消费第一大 国, 在生产栽培中, 叶片颜色常常会发生变突变, 表现出白化、 黄绿、 延迟变绿、 斑驳、 斑点等 表型。 叶色突变体是研究光合作用、 叶绿素合 成以及叶绿体发育的理想材料, 同时也是遗传 和育种中重要的研究材 料。 [0003]在传统的选择育种中, 因为难以确定后代的基因型, 选择的依据通常是植物的表 现型而不是基因型, 选择时间较长, 且表现型易受环境因素的影响, 导致选择的不准确和效 率较低。 分子标记辅助育种以与目标性状紧密连锁分子标记为工具对目标性状进行筛选, 通过分子标记以基因型进行种质资源的筛选, 具有准确、 快速、 不受环境条件干扰的优点, 避免了传统育种过程中性状选择的盲目性, 提高了育种效率。 InDel标记是对扩增产 物进行 分析的一种分子标记, 具有高通量、 简单、 稳定、 灵敏度高等特定, 是目前分子标记辅助育种 工作中极具发展前 景的分子标记。 [0004]西瓜叶片黄化性状是目前发现的苗期鉴定西瓜杂交种子纯度最理想的标记性状。 西瓜叶片黄化性状植株叶片全生育期均为黄化叶片, 而正常绿植株叶片全生育期均为绿 色。 因此, 黄化与一般正常绿幼苗或植株有明显的区别, 最早鉴别期在子叶出土到幼苗1片 真叶期间, 时间在播种后7 ‑10d。 通过鉴定黄化基因, 开发其紧密连锁的分子标记进行品种 初期筛选, 达到分子辅助育种的目的, 可 大大缩短育种的周期, 提高育种效率。 [0005]西瓜叶片黄化性状在苗期即能准确鉴定杂种, 具有准确、 直观、 简便、 快速、 低耗等 优点。 但该性状是隐性的, 杂交一代不表现, 给选育工作带来了很大难度。 叶色是西瓜重要 的农艺性状, 与西瓜植株的光合作用能力息息相关, 因此急需深入开展西瓜叶色研究, 开 发 可用于西瓜育种的分子标记, 以缩短育种进程 提高育种效率。 发明内容 [0006]本发明的目的在于提供一种与西瓜叶片黄化性状相关的InDel分子标记及其应 用, 可以用来对西瓜品种进行初期筛 选, 检测方法确可靠, 能够大 大缩短育种周期。 [0007]为实现上述目的, 本发明采用以下技 术方案: 本发明提供一种与西瓜叶片黄化性状相关的InDel分子标记, 所述InDel分子标记 的连锁基因位点开始于西瓜参考基因组97103V2版本的第2号染色体第16217471bp位碱基 处, 所述InDel分子标记的扩增长度为122bp和/或142bp, 若扩增基因片段长度为122bp则为 西瓜叶片 黄化纯合单株, 若扩增基因片段长度为 142bp则为西瓜叶片正常绿纯合单株, 若扩 增基因片段长度为12 2bp和142bp则为西瓜叶片正常绿杂合单株。说 明 书 1/4 页 3 CN 115058536 A 3
专利 与西瓜叶片黄化性状相关的InDel分子标记及其应用
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