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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210679148.7 (22)申请日 2022.06.16 (71)申请人 江苏省家禽科 学研究所 地址 225200 江苏省扬州市邗江区仓颉路 58号 (72)发明人 童海兵 邵丹 施寿荣 胡艳 王强 沈一茹 张珊 肖蕴祺 张安 陈静龙 (74)专利代理 机构 上海智信专利代理有限公司 31002 专利代理师 王洁 郑暄 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12N 15/11(2006.01) C12Q 1/6858(2018.01) (54)发明名称 与鸡低温耐受相关的分子标记、 引物组合及 相应的选 育方法 (57)摘要 本发明提供了一种鉴定鸡低温耐受品种的 分子标记、 引物组成及相应的选育方法, 分子标 记位点位于NCBI上鸡的参考基因组(Gallus Gallus 5.0)第Z号染色体第16134664核苷酸处 的A>G突变与鸡低温耐受相关, 能够用于家禽低 温耐受品种的筛 选, 其鉴定效率及准确率高。 权利要求书1页 说明书4页 序列表1页 附图4页 CN 114875161 A 2022.08.09 CN 114875161 A 1.一种与鸡低温耐受相关的SNP分子标记, 其特征在于, 所述的SNP分子标记位点位于 NCBI上鸡的参考基因组Gallus Gallus 5.0第Z号染色体第16134664位, 所述的位点处碱基 是A或G。 2.根据权利要求1所述的与鸡低温耐受相关的SNP分子标记, 其特征在于, 所述分子标 记的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示且第5 3位碱基是A或G。 3.根据权利要求1或2所述的与鸡低温耐受相关的SNP分子标记, 其特征在于, 所述分子 标记的低温 耐受基因型为A A基因型。 4.一种用于检测根据权利要求1或2所述的SNP分子标记的引物 组合, 其特征在于, 所述 引物组合具体如下组成: 上游引物F: G GCCTGTGCACA AATTACAACA(SEQ ID NO.1) 下游引物R: GTG GCTGAATACCACTGGACA(SEQ ID NO.2)。 5.一种选 育低温耐受的鸡的方法, 其特 征在于, 包括以下步骤: (1)提取鸡的基因 组DNA; (2)利用引物SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2对提取 的基因组DNA进行PCR扩增, 得到扩增 产物; (3)对扩增产物进行测序, 选择测序结果中基因型为A A的群体。 6.根据权利 要求5所述的选育低温耐受的鸡的方法, 其特征在于, 所述的步骤(2)中PCR 反应条件为: 预变性94℃3min; 变性94℃3s, 退火58℃30s, 延伸72℃1min, 重复35个循环, 循 环外延伸72℃5mi n。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114875161 A 2与鸡低温耐受相关的分子标记、 引物组合及相应的选育方 法 技术领域 [0001]本发明涉及基 因工程和遗传育种领域, 具体涉及 一种与鸡低温耐受相关的分子标 记、 引物组合及相应的选 育方法。 背景技术 [0002]随着畜牧业规模化、 集约化发展, 应激因子亦越来越多。 一般来说, 畜禽越小, 对应 激越敏感, 家 禽表现尤甚。 在家 禽生产中, 不可避免地要面对 各种类型的应激, 包括高温、 低 温、 转群、 运输等, 而低 温是畜禽养殖业面临的最具挑战的应激之一。 尤其在我国的冬春季 节, 温度变化突然且降温幅度大, 一旦管理不当, 鸡群就有 可能因为冷应激而引起家禽体内 酸碱失衡、 内分泌紊乱等, 进而影响家禽的生长性能的发挥, 甚至引发潜在疾病, 导致大批 量死亡。 目前, 针对家 禽冷应激除了加强日常管理外, 或通过提高能量、 降低蛋白、 添加小肽 等措施改善营养水平, 或添加维生素E、 中草药、 绿茶粉等抗冷应激物质, 但 这些方式缓解效 果有限, 仍无法满足临床需要。 因此, 耐低温品种的选 育也是家禽养殖业的迫切需求。 [0003]分子育种是利用DNA分子标记对育种素材进行选择的技术, 能快速地提升子代的 经济性状。 单核苷酸多态性(SNP)是目前应用最广、 最新的分子标记。 目前国内外关于鸡低 温耐受的分子标记开发的研究尚少, 且在产业中缺 乏可应用于分子标记辅助育种的标记。 因此开发耐受低温性状的分子标记对家禽的健康养殖及加速 育种进程具有重要的意 义。 发明内容 [0004]本发明提供了一种鉴定鸡低温耐受品种的分子标记、 引物组合及相应的选育方 法。 分子标记位点位于NCBI上鸡的参考基因组(Gallus Gallus 5.0)第Z号染色体第 16134664核苷 酸处的A>G突变与鸡低温耐受相关, 能够用于家 禽低温耐受品种的筛选, 其鉴 定效率及准确率高。 为达 到上述发明的目的, 本发明所采用的技 术方案如下: [0005]本发明第一方面提供了一种与鸡低温耐受相关的S NP分子标记, 所述S NP分子标记 位点位于NCBI上鸡的参考基因组(Gallus Gallus 5.0)第Z号染色体第16134664位, 所述的 位点处碱基是A或G。 [0006]较佳地, 所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示且第5 3位碱基是A或G。 [0007]较佳地, 所述分子标记的低温 耐受基因型为A A基因型。 [0008]本发明第二方面提供了一种用于检测上述SNP分子标记的引物组合, 所述引物组 合具体如下组成: [0009]上游引物F: g gcctgtgcaca aattacaaca(SEQ ID NO.1) [0010]下游引物R: gtg gctgaataccactggaca(SEQ ID NO.2)。 [0011]本发明第三方面 提供了一种选 育低温耐受的鸡的方法, 包括以下步骤: [0012](1)提取鸡的基因 组DNA; [0013](2)利用引物SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2对提取的基因组DNA进行PCR扩增, 得到 扩增产物;说 明 书 1/4 页 3 CN 114875161 A 3
专利 与鸡低温耐受相关的分子标记、引物组合及相应的选育方法
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