(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210760840.2 (22)申请日 2022.06.30 (66)本国优先权数据 202111318316.1 2021.1 1.09 CN (71)申请人 连云港市农业科 学院 地址 222243 江苏省连云港市海州开发区 迎宾大道西 (72)发明人 迟铭　邢运高　李景芳　孙志广　 徐波　刘艳　刘晓敏　王宝祥　 (74)专利代理 机构 上海怡恩专利代理事务所 (普通合伙) 31336 专利代理师 牟俊玲 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01)A01H 1/04(2006.01) (54)发明名称 水稻耐高温基因TT1的KASP标记开发及其应 用 (57)摘要 本发明公开了 水稻耐高温基因TT1的KASP标 记开发及其应用， 属于基因生物技术领域。 其中 所述分子标记是与水稻耐高温基因TT1紧密连锁 的KASP标记KASP_TT1， 所述KASP_TT1是水稻基因 组中的一个SNP位点， 其核苷酸种类为A或G， 为序 列表中SEQ  ID No.4的第101位核苷酸。 本发明应 用KASP技术对水稻耐高温基因TT1进行基因型鉴 定， 具有操作简便、 成本低廉、 检测周期短、 标记 稳定、 绿色环保等优点， 可精准检测水稻耐高温 基因TT1， 对促进耐高温水稻育种具有重要意 义。 权利要求书2页 说明书8页 序列表1页 附图2页 CN 115094156 A 2022.09.23 CN 115094156 A 1.水稻耐高温基因TT1的KASP标记开发， 其特征在于： 所述分子标记是与水稻耐高温基 因TT1紧密连锁的KASP标记KASP_TT1， 所述KASP_TT1是水稻基因组中的一个SNP位点， 其核 苷酸种类为A或G， 为序列表中SEQ  ID No.4的第101位核苷酸。 2.根据权利要求1所述的水稻耐高温基因TT1的KASP标记开发的应用， 其特征在于： 在 C1、 C2、 C3或C4中的应用： 所述C1为检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴 定水稻高温 耐性中的应用； 所述C2为检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅 助鉴定耐高温水稻产品中的应用； 所述C3为检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质在水稻辅助育种 或制备水稻辅助育种产品中的应用； 所述C4为检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质在选育耐高温的 水稻资源中的应用。 3.水稻耐高温基因TT1的KASP标记开发的应用， 其特征在于： 提供一种鉴定或辅助鉴定 水稻高温耐性的方法， 包括检测待测水稻的基因型， 根据待测水稻的基因型鉴定或辅助鉴 定水稻高温耐性； 所述基因型为水稻基因组中KASP_TT1位点的基因型； 所述记KASP_TT1位 点是水稻基因组中的一个SNP位点， 其核苷酸种类为A或G， 为序列表中SEQ  ID No.4的第101 位核苷酸。 4.根据权利要求3所述的水稻耐高温基因TT1的KASP标记开发的应用， 其特征在于： 所 述KASP_TT1位点的基因型为AA基因型时， 水稻为耐高温或者候选为耐高温； 所述KASP_TT1 位点的基因型为AG基因型或者GG基因型时， 水稻为不 耐高温或者候选为不耐高温； 其中， 所 述AA基因型表示水稻基因组中所述KASP_TT1位点的核苷酸种类为A的纯合型； 所述GG基因 型表示水稻基因组中所述KASP_TT1位点的核苷酸种类为G的纯合型； 所述AG基因型表示水 稻基因组中所述KAS P_TT1位点的核苷酸种类为A和G的杂合型。 5.根据权利要求3所述的水稻耐高温基因TT1的KASP标记开发的应用， 其特征在于： 提 供一种检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质在A1、 A2、 A3或A4中的应 用； 所述KASP_TT1位点是水稻基因组中的一个SNP位点， 其核苷酸种类为A或G， 为序列表 中 SEQ ID No.4的第101位核苷酸： 所述A1为检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴 定水稻高温 耐性中的应用； 所述A2为检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅 助鉴定耐高温水稻产品中的应用； 所述A3为检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质在水稻辅助育种 或制备水稻辅助育种产品中的应用； 所述A4为检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质在选育耐高温的 水稻资源中的应用。 6.根据权利要求3所述的水稻耐高温基因TT1的KASP标记开发的应用， 其特征在于： 提 供一种选育耐高温的水稻资源的方法， 包括选择KASP_TT1位点的基因型为AA的水稻进行育 种， 其中， 所述KASP_TT1位点是水稻基因组中的一个SNP位点， 其核苷 酸种类为A或G， 为序列权　利　要　求　书 1/2 页 2 CN 115094156 A 2表中SEQ ID No.4的第101位核苷酸； 所述AA基因型表示水稻基因组中所述KASP_TT1位点的 核苷酸种类为A的纯合型。 7.根据权利要求3所述的水稻耐高温基因TT1的KASP标记开发的应用， 其特征在于： 提 供含有检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质的产品， 为E1 ‑E4中任一 种产品： 所述E1为检测与水稻高温 耐性相关的单核苷酸多态性或基因型的产品； 所述E2为 鉴定或辅助鉴定耐高温水稻的产品； 所述E3为用于水稻辅助育种的产品； 所述E4为用于选育耐高温水稻资源的产品。 8.根据权利要求7所述的水稻耐高温基因TT1的KASP标记开发的应用， 其特征在于： 所 述含有检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质的产品在B 1、 B2、 B3或B4 中的应用； 所述B1为检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴 定水稻高温 耐性中的应用； 所述B2为检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅 助鉴定耐高温水稻产品中的应用； 所述B3为检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质在水稻辅助育种 或制备水稻辅助育种产品中的应用； 所述B4为检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质在选育耐高温的 水稻资源中的应用。 9.根据权利要求3、 4、 5、 6、 7或8中任一所述的水稻耐高温基因TT1的KASP标记开发的应 用， 其特征在于： 所述检测检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质为如 下D1、 D2或D3： 所述D1为所述检测检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质含有扩 增包括所述KAS P_TT1位点在内的水稻基因 组DNA片段的PCR引物； 所述D2为所述检测水稻基因组中KASP_TT1位点的多态性或基因型的物质为含有所述 PCR引物的PCR试剂； 所述D3为含有D1所述PCR引物或D2所述PCR试剂的试剂盒。 10.根据权利 要求9所述的水稻耐高温基因TT1的KASP标记开发的应用， 其特征在于： 所 述PCR引物为P1或P2： P1、 所述PCR引物为由核苷酸序列是序列表中SEQ  ID No.1的第22 ‑45位的单链DNA、 核 苷酸序列是序列表中SEQ  ID No.2的第22 ‑45位的单链DNA和核苷酸序列是序列表中SEQ  ID  No.3的单链DNA组成的引物组； P2、 所述PCR引物为由序列表中SEQ  ID No.1所示的单链DNA、 序列表中SEQ  ID No.2所 示的单链DNA和由序列表中SEQ  ID No.3所示的单链DNA的引物组。权　利　要　求　书 2/2 页 3 CN 115094156 A 3