(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210641501.2 (22)申请日 2022.06.07 (71)申请人 上海市农业科 学院 地址 201106 上海市闵行区北翟路2 901号 (72)发明人 周琳　蔡友铭　张永春　杨柳燕　 陈敏敏　聂功平　李心　 (74)专利代理 机构 南京华恒专利代理事务所 (普通合伙) 32335 专利代理师 裴素艳 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 用于朱顶红杂交后代 鉴定的SSR分子标记组 合、 SSR引物组合及其应用 (57)摘要 本发明公开一种用于朱顶红杂交后代鉴定 的SSR分子标记组合、 SSR引物组合及其应用， 本 发明基于朱顶红转录组数据开发EST ‑SSR标记， 以朱顶红亲本和杂交后代基因组DNA为模板， 使 用SSR引物进行PCR扩增， 通过毛细管电泳， 进行 朱顶红亲本和杂交后代的EST ‑SSR分析， 可用于 朱顶红杂交后代的早期鉴定。 本发 明的检测方法 适用于朱顶红ES T‑SSR分子标记开发及其杂交后 代的早期鉴定， 既提高了朱顶红杂交育种效率， 又降低了杂交后代株系的管 理成本， 具有准确性 高、 操作简便等优点。 权利要求书2页 说明书13页 序列表4页 CN 115198030 A 2022.10.18 CN 115198030 A 1.用于朱顶红杂交后代鉴定的SSR分子标记组合， 其特征在于， 所述组合中的SSR分子 标记分别由具有如下核苷酸序列的引物对 扩增所得： 2.用于朱顶红杂交后代鉴定的SSR引物 组合， 其特征在于， 所述组合包括具有如下核苷 酸序列的引物对： 3.一种试剂盒， 其包 含权利要求2所述的S SR引物组合。 4.权利要求1所述的SSR分子标记组合、 权利 要求2所述的SSR引物组合、 或权利 要求3所 述的试剂盒在朱顶红杂交后代鉴定中的应用。 5.朱顶红亲本及其杂交后代 的分子身份证， 其特征在于， 采用权利要求2所述SSR引物 或权利要求3所述试剂盒， 对朱顶红样品的DNA进行PCR扩增， P CR产物进 行电泳检测， 将 每个 个体的等位基因转换成为1和 0字符串， 最终得到朱顶红亲本及其杂交后代的由1、 0编号的 原始数据， 作为每一个朱顶红样本的 ‘分子身份 证’。 6.根据权利要求5所述的朱顶 红亲本及其杂交后代的分子身份证， 其特征在于， 所述朱 顶红亲本中， 母本品种选择 ‘Picotee’、‘Rapido’和‘Naran ja’， 父本品种选择 ‘Blossom 权　利　要　求　书 1/2 页 2 CN 115198030 A 2peacock’、‘Sunny nymph’、‘Matterhorn ’、‘Luna’和‘Naran ja’， 共配置6组杂交组合， 分别 为♀Picotee×♂Blossom peacock、 ♀Rapido×♂Blossom peacock、 ♀Picotee×♂Sunny  nymph、♀Picotee×♂Matterhorn、 ♀Naran ja×♂Luna、♀Luna×♂Naran ja。 7.一种朱顶红杂交后代鉴定方法， 其特 征在于， 包括如下步骤： 1)朱顶红亲本和杂交后代DNA提取； 2)采用权利要求2所述的SSR引物组合或权利要求3所述的试剂盒， 对朱顶红亲本和杂 交后代PCR扩增； 3)扩增产物毛细管电泳检测； 4)根据电泳结果， 将每个个体的等位基因转换成为1和0字符串， 最终得到朱顶红亲本 及其杂交后代的 由1、 0编号的原 始数据； 5)将步骤4)的结果与权利要求5所述的分子身份证进行比对， 进行朱顶红杂交后代鉴 定鉴定， 如果杂交后代间， 编号完全一 致， 则为重复样本 。权　利　要　求　书 2/2 页 3 CN 115198030 A 3