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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210832154.1 (22)申请日 2022.07.15 (71)申请人 纳昂达 (南京) 生物科技有限公司 地址 210031 江苏省南京市江北新区华康 路142号南京生物医药谷加速器三期 A01栋南侧3 -4层 (72)发明人 胡玉刚 曲燕 章明晔 蒋才 汪彪 吴强 (74)专利代理 机构 北京康信知识产权代理有限 责任公司 1 1240 专利代理师 金田蕴 (51)Int.Cl. C12Q 1/6806(2018.01) C12Q 1/6869(2018.01) C40B 50/06(2006.01)C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 质控双端唯一标签接头合成串扰的方法及 装置 (57)摘要 本发明公开了一种质控双端唯一标签接头 合成串扰的方法及装置。 该方法包括: 包Lane测 序: 等量的超声打断基因组DNA构建文库, 等比例 混合N个文库后进行包lane测序, 测序后分析正 常双端标签组合和异常双端标签组合占比; 和/ 或跨平台混合测序: 等量的超声打断基因组DNA 用第一测序平台的双端唯一标签接头构建文库, 等比例混合N个文库再用第二测序平台的双端唯 一标签接头建库; 在第二测序平台进行测序获得 测序数据; 按照标签序列拆分后的测序数据进行 第一测序平台的正常双端标签组合和异常双端 标签组合占比分析。 通过建立质控方法和标准, 控制合成环节的串扰水平, 实现双端唯一标签在 后续应用过程中去除串扰的发生实现精准检测 的目的。 权利要求书1页 说明书8页 附图6页 CN 115197999 A 2022.10.18 CN 115197999 A 1.一种质控双端唯一标签接 头合成串扰的方法, 其特 征在于, 包括以下步骤: 包Lane测序: 等量的超声打断基因组DNA用双端唯一标签接头构建文库, 等比例混合N 个文库后进行包lane测序, 测序后分析正常双端标签组合和异常双端标签组合占比; 和/或 跨平台混合测序: 等量的超声打断基因组DNA用第一测序平台的双端唯一标签接头构 建文库, 等比例混合N个文库再用第二测序 平台的双端唯一标签接头 建库; 在所述第二测序 平台进行测序获得测序数据; 按照标签序列拆分后的测序数据进 行所述第一测序 平台的正 常双端标签组合和异常双端标签组合占比分析。 2.根据权利要求1所述的方法, 其特征在于, 所述第 一测序平台为MGI测序平台, 所述第 二测序平台为Illumina测序平台; 或所述第一测序平台为Illumina测序平台, 所述第二测 序平台为MGI测序平台。 3.根据权利 要求1所述的方法, 其特征在于, 所述N个文库 为8m, 其中, m为正数; 优选N个 文库为24个文库或48个文库。 4.根据权利要求1所述的方法, 其特征在于, 当大于96组双端唯一标签时, 采用所述包 Lane测序的方法进行; 当小于96组双端唯一标签时, 采用所述 跨平台混合测序的方法进行。 5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法, 其特征在于, 当所述正常双端标签组合的 占比大于等于98.5%, 异常双 端标签组合单独一项不高于0.3%, 且标签碱基缺 失小于等于 2.5%时, 判断所述双端唯一标签接 头合格。 6.一种质控双端唯一标签接 头合成串扰的装置, 其特 征在于, 包括: 包Lane测序单元: 配置为等量的超声打断基因组DNA用双端唯一标签接头构建文库, 等 比例混合N个文库后进行包lane测序, 测序后分析正常双端标签组合和异常双端标签组合 占比; 和/或 跨平台混合测序单元: 配置为等量的超声打断基因组DNA用第一测序平台的双端唯一 标签接头构建文库, 等比例混合N个文库再用第二测序 平台的双端唯一标签接头 建库; 在所 述第二测序平台进行测序获得测序数据; 拆分后的测序数据进行所述第一测序平台的正常 双端标签组合和异常双端标签组合占比分析。 7.根据权利要求6所述的装置, 其特征在于, 所述第 一测序平台为MGI测序平台, 所述第 二测序平台为Illumina测序平台; 或所述第一测序平台为Illumina测序平台, 所述第二测 序平台为MGI测序平台。 8.根据权利 要求6所述的装置, 其特征在于, 所述N个文库 为8m, 其中, m为正数; 优选N个 文库为24个文库或48个文库。 9.根据权利要求6所述的装置, 其特征在于, 当大于96组双端唯一标签时, 采用所述包 Lane测序单 元; 当小于96组双端唯一标签时, 采用所述 跨平台混合测序单 元。 10.根据权利要求6至9中任一项所述的装置, 其特征在于, 当所述正常双端标签组合的 占比大于等于98.5%, 异常双 端标签组合单独一项不高于0.3%, 且标签碱基缺 失小于等于 2.5%时, 判断所述双端唯一标签接 头合格。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 115197999 A 2质控双端唯一标签接头合成串扰的方 法及装置 技术领域 [0001]本发明涉及高通测序技术领域, 具体而言, 涉及一种质控双端唯一标签接头合成 串扰的方法及装置 。 背景技术 [0002]高通量测序是目前比较重要的获取 医学诊断和科研信息的手段, 其准确性非常重 要。 由于高通量测序产生的数据很多, 仅一次测序就会产生大量的测序数据, 例如, MGISeq ‑ T7和Illumina NovaSeq6000单次测序就可以产生6Tb的测序数据。 因为同一次测序要混合 很多样本测序, 由于混合操作和测序过程中样本之间会有一定的串扰, 目前通常用双端标 签建库接头方式消除样本 之间的干扰, 例如, 专利CN111910258B公开了针对MGI测序平台解 决串扰的双端 标签的建库接头和CN113999893A公开了兼容双测序平台MGI和Illumina的双 端标签建库接头。 通过双 端标签可以降低100倍的样本 之间相互干扰, 这样可以使医学检测 的低频检测更准确, 科 学研究更严谨和可信。 [0003]在医学检测过程中, 由于肿瘤样的占比和异质性, 重要的靶向突变位点的频率在 0‑50%不等, 或者检测的是病人样本的cfDNA(血液游离DNA), 检测到很低频率对被检测者 都会很有意义, 所以需要保证检测的准确性。 在科学研究 的过程中同样要求检测的准确性, 比如在研 究植物的miRNA过程中, 由于一些miRNA的表达丰度很高, 如果不同物种研 究的小 分子RNA测序混合在一次测序过程, 如果是单标签测序, 由于标签串扰导致的 “重大科研发 现”也会发生, 导致这种现象的出现是 因为不了解高通测序单端 标签会导致测序串扰, 会产 生张冠李戴的结果。 [0004]虽然双端标签建库接头可以解决样本串扰问题, 但是要在接头合成质量和产品生 产时进行严格的质控, 避免由于接头合成和纯化过程中已经导致的污染失去双端标签去除 污染的效果。 [0005]本发明就是在生产过程中严格质控合成质控, 保证双端标签能够有效去除串扰干 扰。 发明内容 [0006]本发明旨在 提供一种质控双端唯一标签接头合成串扰的方法及装置, 以避免在合 成过程中导致的污染使双端 唯一标签接头失去去除样本之间混合测序串扰功 能的技术问 题。 [0007]为了实现上述目的, 根据本发明的一个方面, 提供了一种质控双端唯一标签接头 合成串扰的方法。 该方法包括以下步骤: 包Lane测序: 等量的超声打断基因组DNA用双端唯 一标签接头构建文库, 等比例混合N个文库后进行包lane测序, 测序后分析正常双 端标签组 合和异常双端标签组合占比; 和 /或跨平台混合测序: 等量的超声打断基因组DNA用第一测 序平台的双端唯一标签接头构建文库, 等比例混合N个文库再用第二测序平台的双端 唯一 标签接头建库; 在第二测序平台进行测序获得测序数据; 按照标签序列拆分后的测序数据说 明 书 1/8 页 3 CN 115197999 A 3
专利 质控双端唯一标签接头合成串扰的方法及装置
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